Desde el momento en que se hace con el control político de la situación, Franco plantea como necesario dar una cobertura ideológica al régimen que estaban creando, por ello crea un partido mixto entre la Falange Española y de la JONS y la Comunión Tradicionalista. En Abril de 1937 se realiza el decreto de Unificación por el que se creaba un partido único: la Falange Española Tradicionalista de la JONS. Ante el avance de las tropas y su supremacía en 1938 se forma un gobierno, desapareciendo la Junta Técnica. La primera ley que crea este nuevo gobierno es el Fuero del Trabajo que establecía el sindicato vertical, la prohibición de la huelga y de cualquier otra reivindicación obrera. Además se hace una apuesta clara por la preeminencia de la Iglesia y el conservadurismo, acabando de esta manera con toda la obra reformadora de la II República. El 1 de Abril de 1939 se proclama el último parte de guerra por el cual se anuncia la derrota del bando republicano, y el nacimiento de un nuevo estado dirigido por Francisco Franco.
La guerra táctica presenta las siguientes etapas:
– Del golpe al avance sobre Madrid (7/11/1936)
– Las Batallas en torno a Madrid (12/1936 – 3/1937)
– La ocupación del Norte (de Abril a Octubre de 1937)
– Avance hacia el Mediterráneo (11/1937 – 6/1938)
– La Batalla del Ebro y la ocupación de Cataluña (6/1938 – 2/1939)
– Final de la guerra (2/1939 – 3/1939)
El avance sobre Madrid se hace desde el sur con las tropas de Yagüe tomando Badajoz con el fin de establecer una estrecha franja con las tropas del Norte lideradas por Mola. Por su parte Franco se desplaza a Toledo para acabar con el cerco del Alcázar. En Octubre de 1936 estaban a las puertas de Madrid, sin embargo la movilización general de la ciudad de Madrid tanto de hombres como mujeres evitaron la entrada de las tropas sublevadas, gracias al apoyo de las brigadas internacionales y de las columnas de anarcosindicalistas, como la de líder anarquista Durruti. El general Miaja se hace con el control de Madrid, pues el gobierno republicano se traslada, entonces a Valencia.
Las batallas en torno a Madrid se aplican como una respuesta directa a la imposibilidad de hacerse con la capital. Los sublevados cambian de estrategia y por ello realizan una serie de iniciativas militares para aislar la capital y cortar las comunicaciones con Valencia, donde estaba el gobierno republicano. Las batallas del Jarama (Febrero de 1937) y de Guadalajara (Marzo de 1937) son las más significativas donde los republicanos hacen muestra de una extraordinaria fuerza haciendo retroceder el frente sublevado.
Franco reorganiza la estrategia abandonando la posibilidad de hacerse con Madrid, por lo que decide concentrar todos sus esfuerzos en hacerse con el control del norte, entre el País Vasco y Asturias, una franja que había quedado totalmente aislada y donde se encontraba un núcleo de resistencia republicana importante. Desde Abril de 1937 hasta Octubre del mismo año se producen las batallas más cruentas de la guerra, como el desastre de Guernica y Belchite, ciudades totalmente arrasadas por el bombardeo de la aviación alemana. El 19 de Julio Bilbao es ocupado, más tarde Zaragoza, en Agosto Santander y en Octubre Asturias, perdiendo la República una de las zonas más ricas de la España del Siglo XX.
De Noviembre de 1937 hasta Junio de 1938 se produce el avance hacia el Mediterráneo, el último bastión republicano. La ciudad de Teruel fue ocupada por republicanos, y luego retomada por las fuerzas sublevadas, desde donde Franco reinicia las maniobras para hacerse con el control del Mediterráneo. Las fuerzas republicanas confían en el general Rojo y en la reorganización de las tropas y el reconocimiento de las brigadas internacionales. Las campañas sublevadas de Aragón hicieron que Maestrazgo y Vinaroz en Castellón fueran tomadas en Abril de 1938. El territorio republicano quedó dividido en 2, dificultando las maniobras y favoreciendo las campañas del bando sublevado hacia el sur manteniendo fuertes combates en Castellón y Valencia. El ejército republicano recibe nuevas armas y se plantea un contraataque sobre el valle del Ebro, en la provincia de Tarragona. Desde Junio hasta Noviembre de 1938 se dieron varios enfrentamientos que comenzaron de forma favorable para los republicanos, pero que acabaron la victoria de los sublevados que hicieron uso de las fuerzas de la aviación alemana e italiana. Desde entonces, el bando sublevado escaseaba en cuestión de recursos y fuerzas militares que se encontraban mermadas y desorganizadas. El 26 de Enero las tropas de Franco entraban sin resistencia alguna en Barcelona, mientras que el gobierno republicano se trasladaba a Francia. En la última etapa de la guerra las fuerzas republicanas solo permanecían en Madrid, la Mancha, y la zona que abarca desde el Norte de Valencia hasta Almería, el resto era dominio nacional. El último gran asedio fue sobre la ciudad de Madrid, controlada por el general Casado, que desde hacía meses había pactado la rendición de la ciudad con el servicio de espionaje franquista. Un malentendido entre Negrín y Casado llevó a que se produjera un enfrentamiento contra las fuerzas comunistas. Con el apoyo de la UGT Casado buscó la rendición de la ciudad, sin embargo Franco quería una rendición sin condiciones, por lo que el 28 de Marzo entraba en la ciudad sin la mayor resistencia. El 1 de Abril Franco firma el último parte de guerra en el que declara el fin de la guerra.
El resultado final de la guerra se traduce en muerte, carestía económica y una fuerte represión. Se produjeron miles de muertos tanto de militares como de civiles por ataques aéreos, a los que sumamos un gran número de muertos por desnutrición, y enfermedades contagiosas, desde el momento en que empezaron a escasear los bienes de primera necesidad en la zona republicana. Los bombardeos y enfrentamientos generaron la destrucción de carreteras e infraestructuras urbanas, siendo especialmente afectadas las ciudades de Madrid, Barcelona, Valencia y Málaga, entre otras. Los precios de los productos aumentaron, y el mercado negro se extendíó. Muchas personas tuvieron que exiliarse por motivos políticos, ideologías o participación en partidos o asociaciones republicanas o de extrema izquierda, así como un total de 13000 niños que fueron enviados a la URSS y a otros países europeos y americanos con el fin de darles la oportunidad de salvarse y educarse en un país con mayor libertad. En los primeros meses de 1939 se exiliaron medio millón de españoles a Francia, de los cuales la mitad volvieron a España en los meses siguientes; otros no corrieron la misma suerte pues acabaron en campos de concentración (St Cyprien y Argelès) conducidos por gendarmes. Pero la consecuencia principal de la guerra es la configuración de la Dictadura de Franco, una dictadura personalista, represiva y autoritaria sin una ideología clara, y que se mantuvo en España hasta Noviembre de 1975.